2. Epidemia cholery – śmierć rodziców i opiekunki dziewczynki; zostaje odnaleziona dopiero po dwóch dniach.
3. Krótki pobyt w domu pastora i brak sympatii ze strony jego dzieci.
4. Wyjazd Mary do Anglii:
- podróż na statku,
- poznanie pani Medlock, gospodyni z Misselthwaite Manor i dalsza podróż pociągiem,
- dotarcie do domu przez wrzosowiska
5. Mary otrzymuje do dyspozycji dwa pokoje i zostaje przestrzeżona przed tym, by korzystała wyłącznie z tego obszaru.
6. Poznanie służącej Marty.
7. Mary po raz pierwszy wybiera się do ogrodów znajdujących się przy posiadłości i zawiera znajomość z ogrodnikiem Benem Weatherstaffem.
8. Dziewczynka poznaje historię tajemniczego ogrodu a także losy żony wuja.
9. Krzyki dochodzące z korytarza – nikt nie chce wyjawić, kto krzyczał.
10. Zwiedzanie domu przez dziewczynkę.
11. Zabawa z gilem w ogrodzie – znalezienie klucza do tajemniczego ogrodu.
12. Marta obdarza Mary skakanką kupioną przez matkę.
13. Znalezienie furtki do tajemniczego ogrodu.
14. Pierwsze chwile w nowo odkrytym miejscu – wstępne zabiegi pielęgnacyjne, plewienie chwastów.
15. Ustalenie z Martą, że jej brat kupi Mary narzędzia i nasionka do ogródka (Mary zachowuje w tajemnicy, co to za ogród).
16. Poznanie Dicka i zdradzenie mu tajemnicy – wspólna praca w ogrodzie.
17. Spotkanie z wujem – Mary może dostać „kawałek ziemi”.
18. Pierwsze spotkanie Mary z Colinem – chłopiec chce, by przychodziła do niego codziennie.
19. Kłótnia kuzynów.
20. Napad Colina i awantura z Mary – udaje jej się uspokoić kuzyna.
21. Mary zdradza kuzynowi tajemnicę ogrodu i planują jego podróż do zakazanego miejsca.
22. Wizyta Dicka u Colina z gromadą zwierząt.
23. Przewiezienie chłopca do tajemniczego ogrodu.
24. Ben Weatherstaff odkrywa tajemnicę dzieci.
25. „Czary”.
26. Powrót Colina do zdrowia i zdziwienie domowników.
27. Matka Dicka w ogrodzie.
28. Archibald Craven w podróży – tajemniczy sen i list od pani Sowerby; decyzja o powrocie do domu.
29. Szczęśliwe spotkanie ojca z synem.